Die meisten Fundstücke aus der Antike oder aus der Römerzeit findet man in den Mauern des Logothetis-Kastells verbaut, für das die antiken Ruinen als Steinbruch benutzt wurden.
Das Areal, auf dem heute das Kastell und die Kirche stehen, war vermutlich bereits um 3000 v. Chr. besiedelt. Hier lag die Akropolis der antiken Stadt Samos und später, zu Polykrates’ Zeiten, stand hier sein Palast.
Während der Römerzeit wurden auf dem Kastro-Hügel mehrere luxuriöse Villen gebaut und Samos diente verschiedenen römischen Kaisern, darunter Marc Anton, Augustus, Claudius, Trajan und Hadrian, als „Winterresidenz“.
In byzantinischer Zeit wurde hier im 5. Jahrhundert n. Chr. eine christliche Basilika erbaut, deren Reste man bei Ausgrabungen freigelegt hat. Von den älteren Bebauungen ist nichts mehr vorhanden, allerdings wurden einige antike Steine in das Logothetis-Kastell eingebaut.
Das Kastell des Logothetis aus dem 19. Jahrhundert, in dem heute eine Ausstellung zur Geschichte von Samos zu sehen ist, spielte 1824 während des griechischen Freiheitskampfes eine große Rolle, die Kirche Metamorphosis wurde nach der Befreiung der Insel aus der türkischen Herrschaft aus Dankbarkeit errichtet.
Lage: Pythagorio, Samos 831 03 (ca. 400m westlich des Hafens)